Le master  est structuré comme une qualification de 120 crédits ECTS, comprenant 16 matières obligatoires et 6 matières optionnelles, programmées sur deux années universitaires comme suit :

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Au premier semestre de la première année, les étudiants doivent suivre l'un des deux cours suivants : « Compléments de transport aérien » ou « Calculs relatifs aux aéronefs et aux systèmes d'aéronefs », selon leur spécialisation. Les étudiants se spécialisant dans les véhicules aérospatiaux doivent suivre « Compléments de transport aérien », tandis que ceux se spécialisant dans la navigation aérienne ou les aéroports et le transport aérien doivent suivre « Calculs relatifs aux aéronefs et aux systèmes d'aéronefs ».

Afin de garantir un profil éducatif commun et homogène pour les diplômés de ce programme de master, il peut être nécessaire d'orienter l'inscription des diplômés en génie aérospatial d'universités autres que l'Université de Séville, ou d'autres étudiants titulaires d'autres diplômes de premier cycle les qualifiant pour exercer en tant qu'ingénieurs techniques aéronautiques, en ce qui concerne tout ou partie des matières optionnelles à suivre.

Ainsi, pour ces étudiants, des parcours seront établis au sein des options de cours à option, en fonction des matières étudiées lors de leur licence, en comparant systématiquement leur dossier académique des différents diplômes donnant accès au master avec les objectifs de formation et d'enseignement du programme, composé du diplôme de référence et du master en ingénierie aérospatiale. Ces cours de mise à niveau, qui compteront pour les 30 crédits optionnels, seront, le cas échéant, intégrés aux matières mentionnées dans le schéma précédent.

Les crédits restants, alloués aux cours optionnels (c’est-à-dire ceux qui ne sont pas validés par des cours de mise à niveau), permettront à l’étudiant de choisir les cours optionnels qu’il souhaite suivre parmi ceux proposés. La seule restriction est qu’il ne pourra pas s’inscrire à des cours dont le contenu a déjà été couvert par le programme de licence en ingénierie aérospatiale ou le master (l’objectif étant de compléter la formation reçue). La liste des cours optionnels proposés chaque année universitaire sera un sous-ensemble de ceux présentés dans la figure précédente.

Des stages sont également proposés en option. Ils peuvent être validés par des crédits ECTS de 5, 10 ou 15. Les étudiants doivent s'assurer d'avoir été affectés à une entreprise avant leur inscription. Pour ce faire, ils doivent contacter le bureau des relations internationales de l'ETSi.

En outre, le comité académique du master peut établir des modules de formation complémentaires aux 120 crédits inclus dans le programme de master pour les étudiants qui accèdent au programme en étant titulaires d'un diplôme ne répondant pas aux exigences de l'arrêté ministériel CIN/308/2009. Ces modules de formation complémentaires correspondront, en tout état de cause, à des matières du en génie aérospatial de l'ETSi .